Strukturę organizacyjną Instytutu Nawozów Sztucznych określa regulamin organizacyjny ustalony przez Dyrektora, po zaopinowaniu przez Radę Naukową oraz organizację związkową.

Podstawowymi jednostkami organizacyjnymi w Instytucie są:

zakłady
pracownie, zespoły
sekcje

Skład pionów organizacyjnych i ich strukturę ustala Dyrektor Instytutu, po zasięgnięciu opinii Rady Naukowej.

W skład Instytutu wchodzą:

Pion Dyrektora Instytutu
Pion Badawczy
Pion Handlowo-Finansowy
Pion Techniczny

W Instytucie działają:

Komisje: Oceny Prac Badawczych, Wynalazczości, BHP.
Zespóły: ds. Opiniowania Nawozów, ds. Systemu Jakości.

Instytut jest wydawcą kwartalnika "Przemysł Nawozowy".

Udział Instytutu w SIECIACH, FUNDACJACH i SPÓŁKACH:

Naukowa Sieć Tematyczna "Technologie Ochrony Środowiska" ENVITECH - Net.
Konsorcjum "ECOTECH - COMPLEX - Człowiek, Środowisko, Produkcja (2007 - 2013)".
Konsorcjum na rzecz eksploatacji i użytkowania Ogólnopolskiej Sieci Optycznej jednostek badawczo-akademickich PIONIER.
Konsorcja na rzecz realizacji projektów badawczych zamawianych (2007-2010):

Chemia perspektywicznych procesów i produktów konwersji węgla;
Inżynieria procesów ograniczania emisji oraz utylizacja gazów szkodliwych i cieplarnianych;
Nowe metody dezodoryzacji w produkcji przemysłowej, rolnej i gospodarce komunalnej.

Fundacja "Puławskie Centrum Przedsiębiorczości".
Spółki:

PPH "PETROCHEMIA" Sp. z o.o. w Krakowie,
"MEDICAL" Sp. z o.o. w Puławach,
Spółdzielnia Mleczarska "KAMOS" w Białej Górze, woj. dolnośląskie.

Dyrektor (DN): dr inż. Cezary Możeński
Telefon: 814731400

Dyrektor Naukowy (NB): dr inż. Józef Sas
Telefon: 814731402

Komisja Oceny Prac Badawczych

Sekretarz Naukowy (NBS): dr inż. Edward Rój
Telefon: 814731450

Pełnomocnik ds. Jakości (NBJ): dr inż. Józef Sas
Telefon: 814731402

Dyrektor Handlowo-Finansowy (NF):

Dyrektor Techniczny (NT): mgr inż. Stanisław Jaworski
Telefon: 814731505, fax: 814731506

Komisja Wynalazczości

Rada Techniczna

Dział Kadr (NK)
Kierownik: mgr inż. Leszek Kalisz
Telefon: 814731421

Dział Administracyjno-Prawny (NO)
Kierownik: mgr Waldemar Wawer
Telefon: 814731422

Inspektor Kontroli Gospodarczej (NIG)

Inspektor BHP i P. Poż (NIB)
Inspektor: mgr Andrzej Bajson
Telefon: 814731428

Zakład Technologii Azotowych (BT)
  Kierownik:   dr inż. Janusz Cwalina
  Telefon: 814731465
  Zastępca kierownika:   mgr inż. Bożena Możeńska
  Telefon: 814731467

Zakład Nawozów (BN)
  Kierownik:   dr inż. Andrzej Biskupski
  Telefon: 814731455
  Zastępca kierownika:   dr inż. Mieczysław Borowik
  Telefon: 814731456

Zakład Katalizatorów (BK)
  Kierownik:  dr Paweł Kowalik
  Telefon: 814731441
  Zastępca kierownika:   dr inż. Ryszard Narowski
  Telefon: 814731442

Zakład Ekstrakcji Nadkrytycznej (BX)
  Kierownik:  dr inż. Edward Rój
  Telefon: 814731450
  Zastępca kierownika:   mgr inż. Agnieszka Dobrzyńska-Inger
  Telefon: 814731452

Zakład Technologii Organicznych (BO)
  Kierownik:  dr Andrzej Łodyga
  Telefon: 814731439, 814731527
  Zastępca kierownika:  mgr inż. Piotr Tyński
  Telefon/faks:146372102

Zakład Analityczny (BA)
  Kierownik:  mgr Bożena Górecka
  Telefon: 814731430
  Zastępca kierownika:   mgr Mariusz Chmiel
  Telefon: 814731431

Zakład Wspomagania Badań (BI)
  Kierownik:  mgr inż. Alicja Stołecka
  Telefon: 814731474
  Zastępca kierownika:  Małgorzata Tomkowicz
  Telefon: 814731419

Dział Głównego Księgowego (FG)
  Główny Księgowy: Maria Zaborowska
  Telefon: 814731477
  Zastępca Głównego Księgowego:  mgr Janina Lenart
  Telefon: 814731478

Dział Analiz, Pozyskiwania Środków i Rozliczeń Projektów (FP)
Kierownik: mgr Krystyna Rój
Telefon: 814731481

Dział Marketingu i Sprzedaży Technologii i Katalizatorów (FM)
Kierownik: mgr Bogusław Niewiadowski
Telefon/faks: 814731483

Dział Handlowy (FH)
Kierownik: inż. Waldemar Strachota
Telefon: 814731524, faks: 814731488

Zakład Badań Półtechnicznych (TP)
Kierownik: mgr inż. August Turczyn
Telefon: 814731526

Zakład Produkcji Doświadczalnych (TD)
Kierownik: mgr inż. Jerzy Jesiołowski
Telefon: 814731503, fax: 814731506

Dział Wsparcia Technicznego (TT)
Kierownik: mgr inż. Mirosław Bąk
Telefon: 814731507, fax: 814731506

Stacja Nawozów Płynnych (TS)
  Kierownik:  mgr inż. Zdzisław Banaszak
(z uwagi na słabe łacze w TS można korzystać z dobrego łacza do TG)
  Telefon/faks:  768709396
  adres:  Stacja Nawozów Płynnych INS
  Łagiewniki Średzkie 12
  55-340 Udanin
  powiat średzki, woj. dolnośląskie

Gospodarstwo Doświadczalne Goczałków (TG)
  Kierownik:  Władysław Jawilak
  Telefon: 748559512, fax: 748559887
  adres:  INS w Puławach
  Gospodarstwo Doświadczalne Goczałków
  Goczałków Górny 8
  58-152 Goczałków